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一種簡單快速的miRNA檢測新方法

[2012/8/31]

  “賽默飛之生物通2012實驗室創(chuàng)新技術(shù)大獎”評選活動開展以來,陸陸續(xù)續(xù)收到不少項目,這些項目中有的能減少實驗步驟,有的能降低實驗成本,還有一些改進(jìn)了實驗設(shè)備,讓我們的實驗過程更加輕松。

  參選項目:一種簡單快速的miRNA檢測新方法----液相雜交顯色法

  背景:MicroRNAs(miRNAs)是近年來發(fā)現(xiàn)的在進(jìn)化上高度保守的一類非編碼小RNA(~22nt)。它作為轉(zhuǎn)錄后關(guān)鍵的基因表達(dá)調(diào)控子可參與幾乎所有的生理和病理過程,革新了我們對基因表達(dá)調(diào)控的傳統(tǒng)認(rèn)識。miRNAs的檢測是其功能研究的基礎(chǔ),但小片段的特性使其檢測十分困難。

  PCR和Northernblot是目前檢測單個miRNA最廣泛使用的兩種方法。PCR方法敏感性高,但假陽性的憂慮和引物設(shè)計的困難限制了它的使用。Northernblot是非常有效的檢測工具,但傳統(tǒng)的固相雜交技術(shù)程序復(fù)雜、時間漫長且操作不便。新出現(xiàn)的液相雜交技術(shù)檢測速度快,但需要特定的熒光信號檢測儀器。

  方法改進(jìn):我們這里報道一種新的miRNA檢測方法:液相雜交顯色法(LHCD)。

  這種方法是將提取純化的小RNA與5’端生物素標(biāo)記的DNA探針進(jìn)行液相雜交,接著用核酸外切酶消化多余的探針,再將雜交液點(diǎn)于尼龍膜上,之后ABC孵育,最后BCIP/NBP、DAB或者ECL顯色。

  LHCD能夠區(qū)別miRNA家族成員間一個堿基的差異,其靈敏度可以達(dá)到2.5fmol,全過程耗時不到3個小時。本方法由于整合了快速液相雜交和親和素-生物素信號放大系統(tǒng)(ABC)兩大技術(shù),不但實現(xiàn)了miRNA的簡單、快速、高靈敏度檢測,其可視化的信號目測,還省去了昂貴的信號檢測儀。此外,本方法簡單的操作流程,使其容易學(xué)習(xí)和方便使用。